4073
0
TCMID数据库
TCMID数据库于2005年首次推出，公开且免费，由新加坡国立大学药学系生物信息学与药物设计（BIDD）小组维护，TCMID数据库提供了有关中药配方、草药、草药成分、靶点、药物和疾病等多方面的信息。
推荐指数：
详细信息
TCMID的全称是Traditional Chinese Medicine Information Database，TCM-ID是促进中医药研究和临床研究的免费公开资源，TCM-ID于2005年首次推出，由新加坡国立大学药学系生物信息学与药物设计（BIDD）小组维护。TCM-ID数据源主要有以下渠道：
1.中医方剂及治疗病收集
从新加坡国家食品药品监督管理总局、中国药典（2015）、《中国经典方剂》、《中国汉方药》、国家中药管理局手工收集的中药方剂7443份，包括方名、成分、功能、症状、治疗现代疾病、传统医学的方剂、证候、证、方方中医，以及台湾草药药典。在当前的 TCM-ID 中，共有 366 个 ICD11（国际疾病分类第 11 次修订版）代码，用于 4,601 个处方。
2.TCM组件
本部分包含中文名称、拉丁名称、英文名称、风味和经络趋性、治疗和毒性信息、地理真实栖息地和植物DNA条形码。共2,751个成分，约1,400个常用草药，主要来自《中药材名称综合词典》（第1版）、《中草药名称综合词典》、SymMap、ETCM。特别是从生命数据系统和GenBank收集了草药植物的植物DNA条形码，从真正的草药图谱（ISBN 7-5335-2075-0，ISBN 7-5335-2074-2，ISBN 7-5335-2073-4，ISBN 7-5335-2072-6）手动收集了地理真实栖息地信息。
3.化学成分和靶向基因
从PubChem、ChEMBL、NPASS、ETCM、SymMap中整合了7,375种中草药成分，并从已发表的论文中提取。化学成分的二维结构来自PubChem、ChEMBL和NPASS数据库。此外，从NPASS数据库中获得了基于实验活性的1,292种成分（靶向人类蛋白质<=10uM，病原微生物<=100μM或100ug/ml）以及768种靶标（人类蛋白质：463种，致病微生物：305种）。还包括所有目标的分类信息和Uniprot ID的外部链接。
4.人类样本（健康与疾病）与基因/蛋白质表达测量
通过GEO、ARCHS4和GTEx的编程脚本，初步提取了27,631个人类样本，基因表达测量涵盖了56种疾病。从人类蛋白质组图谱获得具有蛋白表达测量的健康人类样本。人源性细胞系样本也包括在内。
所有实验的摘要或研究设计描述都经过人工检查，以从人类疾病的动物模型中去除样本。此外，组织信息是从数据库提供的样本元数据中提取的，或者是从出版物中手动整理的。由于相同的供体或样本可能包含在多个数据集中或存放到不同的数据库中，因此删除了重复的供体或样本。标记每个样本的可用组学数据类型。
随机推荐