本草组鉴HERB

HERB数据库是集高通量实验数据和参考挖掘数据于一体的天然药物数据库平台。该数据库提供中药材、中药材有效成分、靶基因、疾病、高通量实验和参考挖掘数据的浏览、搜索、查看、下载等功能。

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HERB数据库是集高通量实验数据和参考挖掘数据于一体的天然药物数据库平台。该数据库提供中药材、中药材有效成分、靶基因、疾病、高通量实验和参考挖掘数据的浏览、搜索、查看、下载等功能。草药信息文件7263 种；成分信息49258 成分；靶标信息12933 个；疾病信息 28212 种疾病。

高通量实验：HERB 首次收集了 472 个高通量 GEO 数据集，其中包含 6,164 个 GEO 样本。由特定实验室执行的每个 GEO 数据集都有一个唯一的 GSE 编号。在特定的生物/生物条件下进行的每个GEO样品都有其唯一的GSM编号。我们通过定义 HERB 实验（EXP）手动获得了这些数据的以草药/成分为中心的分类，作为一组与草药/成分相关的对照和治疗 GEO 样品，并在一个 GEO 数据集中以相同条件进行。结果，我们在 HERB 中获得了 1,037 个 EXP。

参考：HERB 通过PubMed文本挖掘收集了自2011年以来发表的17,886篇中药相关论文，然后从1,966个独特的参考文献（137个中草药参考文献和1860个成分参考文献，共1,997条记录）中手动提取了1,241个基因靶点和494个草药/成分的现代疾病。

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