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台湾中医药资料库
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台湾中医药资料库

台湾中医药TCM资料数据库由陈语谦所主持的计算与系统生物学实验室开发以及维护,最后更新时间为2014年。台湾中医药资料库提供443种中医药、两万种纯成份化合物查询,支持cdx(2D结构)和mol2(3D结构)文件格式下载。
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详细信息

台湾中医药资料库TCM主要由陈语谦所主持的计算与系统生物学实验室开发以及维护,网站的经费来自中国医药大学。最后更新时间停留在2014年,是免费中医药数据信息查询网站,目前仅提供中医药成份数据查询,不涉及中草药信息。台湾中医药资料库主要的特点如下:

1.台湾中医药资料库包含中医药四百四十三种,超过两万种纯成份化合物,并且分门别类,提供了简单的查询,包括中医药成份的查询,或已经知道某种成份,而查询此成份在哪几种中医药也会出现。 而进阶查询则提供了以结构为基础的查询,用户可以在软件上画出想要查询的主结构,且再输入限制条件,例如分子量、分子体积、Log P、氢键接受体的数目等等数种条件的复合式查询。

2.台湾中医药资料库的化合物2D结构为cdx档案,3D结构为mol2档,可以在网站上直接以软件观看,也可以直接下载后使用docking软件进行对接,不需要再进行画出化合物的二维结构,再转成三维结构式以及转档或能量的最小化与几何构型的优化。

3.有别于一般中医药或中草药网站,台湾中医药资料库提供每一种中医药完整的化合物(例如川芎在本网站可以查询到含有210种化合物,远比其他中医药网站完整),并且附上参考文献,以供查考。提供用户菜单点选式的下载各种中医药以及中草药的化合物,也可以整个网站的所有中医药化合物一次完整下载,方便用户做某类中医药的研究。

4.台湾中医药资料库提供用户上传的功能,以利此数据库继续增长。

5.在计算服务方面,台湾中医药资料库可以让用户注册后,上传他们需要模拟的蛋白质或药物分子进行对接计算、蛋白质-蛋白质交互作用、并且由于过去实验室已经累积大量的QSAR发表结果,也可以进行活性预测,预测的方式包括QSAR、或使用基因算法找出合适的特性,再以支持矢量机进行模型的建构,再以此模型预测活性。
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