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UniProtKB 蛋白质数据库
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UniProtKB 蛋白质数据库

Universal Protein Resource 是蛋白质序列和注释数据的综合资源数据库,整合了包括EBI(欧洲生物信息研究所),SIB(瑞士生物信息研究所),PIR(蛋白信息资源)等资源。
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详细信息

Universal Protein Resource —— 蛋白质序列和注释数据的综合资源数据库
Universal Protein Resource (UniProt) 是蛋白质序列和注释数据的综合资源数据库,整合了包括EBI(欧洲生物信息研究所),SIB(瑞士生物信息研究所),PIR(蛋白信息资源)等资源。整理出来的国际权威蛋白质数据库,包括以下三个:

UniProtKB(知识库):分为 Swiss-Prot(人工审核注释) 和 TrEMBL(机器自动注释)。

UniRef(参考聚类):去除冗余序列的蛋白质聚类。

UniParc(归档库):存储所有公开蛋白质序列的存档。

它的数据主要来自于基因组测序项目完成后续获得的蛋白质序列。数据库包含了大量来自文献的蛋白质的生物功能的信息。其中UniProtKB(UniProt Knowledgebase)是UniProt数据库的核心部分之一,旨在为生物研究提供全面、高质量且免费的蛋白质序列和功能信息UniProt数据库数据库能够给出靶点更加详细的信息。


数据检索包括基本检索和高级检索:

1)基本搜索

首先进入官网的搜索框中可以直接输入检索内容:如蛋白质名称(如 Insulin)、基因名(如 TP53)、物种(如 Human)、UniProt ID(如 P04637)等。
示例:搜索人类胰岛素 → 输入 insulin human


点击搜索结果如下:共检索到35870条与人类胰岛素相关的蛋白(其中人工校对的有1774条)


点击‘P01308’即可查看该蛋白的详细信息。



2)高级搜索

通过使用字段限定符缩小范围,使检索的结果更准确,如:检索经过人工校对的人类TP53基因相关的蛋白。

首先点击‘Advanced’,然后选择精确的检索条目,最后点击‘search’即可。


结果如下:


如果结果条目很多的话,还可以通过左侧的‘筛选器’(按物种、注释质量、功能等)过滤。

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