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TCMSP数据库
TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform),中药系统药理学数据库与分析平台,TCMSP是建立在中药系统药理学框架之上的。它包括中国药典中注册的全部499种中草药,包括29,384种成分,3,311种靶点和837种相关疾病。为药物筛选和评估提供了 12 个重要的 ADME 相关特性。
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详细信息
旧版TCMSP数据库VS新版TCMSP对比
中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)是建立在中药系统药理学框架之上的。它包括中国药典中注册的全部499种中草药,包括29,384种成分,3,311种靶点和837种相关疾病。为药物筛选和评估提供了 12 个重要的 ADME 相关特性,如人类口服生物利用度、半衰期、药物相似性、Caco-2 通透性、血脑屏障和 Lipinski 五法则。TCMSP还提供每种活性化合物的药物靶点和疾病,可以自动建立化合物-靶点和靶点-疾病网络,让用户查看和分析药物作用机制。
于2024年10月网络资源调研总结(仅供参考):
推荐使用旧版TCMSP数据库的,对其总结如下:
关于中药:其重点主要是收录中草药,而动物药较少。且中草药主要涵盖的是中国药典的500种,较TCMID等数据库还是较少。
关于化合物(成分):化合物收录的较多,且含有OB、DL等药代动力学属性,属于其独特的优势。化合物的结构文件来自于PubChem和ChemBL和ChemSpider,或者结构式画图生成。
关于靶点:靶点信息来自于DrugBank(但不提供链接跳转了)。查询某种药物相关的靶点有哪些是来自于HIT数据库或者模型预测。
关于疾病:疾病信息来自于TTD和PharmGKB。
关于网络:不提供药物-靶点网络和药物-靶点-疾病网络下载了。
关于网站整体用途:1)新中药组合开发;2)活性成分鉴定与筛选;3)系统药理学(最主要的用途)。
新版TCMSP改动如下:
增加药物-靶点等网络展示和图片格式下载功能。
UI更加美观。
隐藏了整体数据集。
所以如果你的药物在TCMSP上查不到成分,或者查到的成分都是槲皮素等假阳性成分,这也是很正常的。推荐使用TCM-ID、TCMID、ECTM、HIT、Herb等数据库进一步查找。
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