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DrugBank
DrugBank数据库是一个整合了生物信息学和化学信息学资源,并提供详细的药物数据与药物靶标信息及其机制的全面分子信息,包括药物化学、药理学、药代动力学、ADME及其相互作用信息...
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详细信息
一、DrugBank网站简介
DrugBank数据库是阿尔伯塔大学提供的一个生物信息学和化学信息学数据库,是一种独特的生物信息学和化学信息学资源,它将详细的药物数据和全面的药物目标信息结合起来。DrugBank Online 是一个全面的、可免费访问的在线数据库,其中包含有关药物和药物靶点的信息。
DrugBank 于 2006 年在阿尔伯塔大学 David Wishart 博士的实验室成立。它最初是一个帮助学术研究人员获得有关药物的详细结构化信息的项目。2011年,它成为代谢组学创新中心(TMIC)的一部分。该项目的范围和受欢迎程度继续增长,并于 2015 年分拆为 OMx Personal Health Analytics Inc。
二、DrugBank网站查询指南
最新版本的 DrugBank Online(版本 5.1.10, 发布时间 2023-01-04) 包含 16,558 个药物条目,包括 2,758 种获批小分子药物, 1,607 种获批的生物制剂(蛋白质、肽、疫苗和过敏原), 135 种及以上营养保健品 6,723 种实验性(发现阶段)药物。此外 5,301 非冗余蛋白 (即药物靶标/酶/转运蛋白/载体)序列与这些相关联 药物条目。每个条目包含 200 多个数据字段,其中一半专门用于药物/化学数据的信息和另一半专门用于药物靶点或蛋白质数据。
DrugBank最大的特色是它支持全面而复杂的搜索,结合DrugBank可视化软件,这些工具能让科学家们非常容易的检索到新的药物靶目标、比较药物结构、研究药物机制以及探索新型药物。
检索药物信息
DrugBank可谓临床导向的药品百科全书。DrugBank能够提供关于药品,药品靶点和药物作用的生物或生理结果的详细、最新、定量分析或分子量的信息。快速检索:“Drugs(药品名)”、“Targets(靶点)”、“Pathways(作用途径)”、“Indications(适应症)”
分类浏览药物信息
可根据不同的标签浏览对应的药物信息,如批准(Approved),保健品(Nutraceutical),违禁药(Illicit),研究药物(Investigational),撤回药物(Withdrawm),实验药物(experimental)等。比如浏览被FDA批准小分子药物,可以查询2723个相关条目。
数据下载和处理
DrugBank提供开放的数据访问接口,可以直接在Download页面进行数据获取,需要注册账号并且申请下载,获得批准后可以下载包括药物结构文件和蛋白质靶标信息等数据。
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